Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms