Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ROPN1BQ9BZX4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROPN1BQ9BZX4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms