Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDEM3Q9BZQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms