Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NSD3Q9BZ95 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NSD3Q9BZ95 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms