Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SCAPERQ9BY12 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms