Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG6Q9BXT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNG6Q9BXT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG6Q9BXT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms