Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDCA4Q9BXL8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDCA4Q9BXL8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms