Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSBP4Q9BWG4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms