Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAIPQ9BWF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAIPQ9BWF2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms