Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MXD3Q9BW11 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MXD3Q9BW11 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXD3Q9BW11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXD3Q9BW11 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms