Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUP58Q9BVL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP58Q9BVL2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms