Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms