Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM43Q9BTV4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM43Q9BTV4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms