Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H2AFJQ9BTM1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2AFJQ9BTM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms