Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
THUMPD2Q9BTF0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms