Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TINF2Q9BSI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms