Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEC22CQ9BRL7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEC22CQ9BRL7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms