Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLF1Q9BQI6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLF1Q9BQI6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms