Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBA1CQ9BQE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBA1CQ9BQE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms