Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBM4BQ9BQ04 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM4BQ9BQ04 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms