Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VGLL1Q99990 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VGLL1Q99990 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms