Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF15Q99988 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF15Q99988 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms