Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUSP9Q99956 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUSP9Q99956 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms