Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT12Q99456 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms