Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SIN3AQ96ST3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
SIN3AQ96ST3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms