Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5RAP2Q96SN8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms