Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UBL7Q96S82 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBL7Q96S82 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms