Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UIMC1Q96RL1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UIMC1Q96RL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms