Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNFRSF13CQ96RJ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms