Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMG1Q96Q15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMG1Q96Q15 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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