Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC17Q96LX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms