Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf72Q96LT7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms