Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC41A2Q96JW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC41A2Q96JW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms