Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHAMP1Q96JM3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAMP1Q96JM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms