Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCPIP1Q96JH7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms