Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms