Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG1Q96JA1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIG1Q96JA1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms