Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC34Q96HJ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms