Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRP36Q96EU6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms