Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MFSD3Q96ES6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD3Q96ES6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms