Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTERF3Q96E29 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms