Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMD3Q96D46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms