Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCTD12Q96CX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCTD12Q96CX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms