Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OPTNQ96CV9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OPTNQ96CV9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OPTNQ96CV9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms