Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCC1Q96CN9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCC1Q96CN9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms