Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC74AQ96AQ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC74AQ96AQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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