Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VTI1AQ96AJ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VTI1AQ96AJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VTI1AQ96AJ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms