Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB7BQ96AH8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB7BQ96AH8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms