Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC17Q96AE7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC17Q96AE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms