Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX21Q969T3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX21Q969T3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms